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CRISPR/Cas12aについて(原称Cpf1)に属するClass 2 Type V型CRISPRシステムは、侵入したウイルスやプラスミドDNAを識別し切断するための細菌と古菌の適応性免疫機構である。Cas 9と比較して、そのdu特の動作モードは遺伝子編集、分子検出及び多遺伝子制御において顕著な優位性を示す。

| パラメータ | CRISPR/Cas12aについて | CRISPR/Cas9について |
|---|---|---|
| 蛋白質の大きさ | 1200~1300アミノ酸(より小さい) | 1000~1600アミノ酸 |
| RNA依存 | のみcrRNA の(traccrRNAなし) | 要crRNA + トラックRNAまたはsgRNAの嵌合 |
| crRNA加工 | 自律RNase活性(組み込み加工能力) | 依存性宿主RNase IIIとtracRNA |
| 切断終端タイプ | 黏性末端(5' 突出) | フラットエンド |
| PAM識別シーケンス | 5'-TTTN/TTTV-3'(Tリッチ) | 5'-NGG-3'(Gリッチ) |
| ヌクレアーゼドメイン | シングルRuvCドメイン | HNH+RuvCデュアルドメイン |
| トランスカット活性 | 有(非特異的切断可能ssDNA) | 無 |
注:
VA/C/G(非T)、例えば5'-TTTA/TTC/TTG-3'。
黏性末端アイソトープ再構築修復(HDR)をより容易にトリガし、正確な編集効率を向上させる。
多遺伝子編集の効率性:
単一のcrRNAアレイは同時に複数の遺伝子を標的にすることができ、traccrRNAを繰り返し構築する必要はなく、複雑な経路制御に適している。
AT濃縮ゲノム適合性:
ATに富むゲノム(植物、寄生虫など)の編集効率はCas 9より顕著に高かった。
低標的離脱リスク:
PAM活性に厳密に依存し、トランスカット活性は閉じられ、全ゲノム脱標的率はCas 9より低い。
配信の利便性:
蛋白質はより小さく、AAVなどのウイルスベクターに包装しやすく、体内遺伝子治療に適している。
| 適用方向 | ケース | 優位性の体現 |
|---|---|---|
| たいでんしノックアウト | トウモロコシ中で3つの干ばつ耐性遺伝子を同時編集、編集効率>60% | crRNAアレイのシンプルな設計 |
| せいみついでんしそうにゅう | 粘性末端増強HDRを用いて、ヒト由来FIX凝血yin子遺伝子の定点修復を実現する | ハイファイ修復 |
| ぶんししんだん | トランスカット活性と結合した核酸検出(CRISPR-DETECT)の開発 | 高感度、PCR増幅不要 |
| 抗ウイルス研究 | カイコからBmNPVウイルス受容体遺伝子を編集、抗ウイルス効率はCas 9より40%向上 | 効率的なAT濃縮ゾーンの切断 |
| 遺伝子治療ベクターの最適化 | Cas 12 b(より小さな変異体)の脱標的率はCas 9より50%低下し、臨床に適している | 高セキュリティ配信 |